Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc11P31313 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms