Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms