Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc6a9P28571 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc6a9P28571 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms