Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa2P28309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa2P28309 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa2P28309 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa2P28309 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa2P28309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa2P28309 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa2P28309 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa2P28309 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Defa2P28309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa2P28309 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa2P28309 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms