Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb9P28076 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms