Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna1P26231 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms