Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PparaP23204 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PparaP23204 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PparaP23204 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PparaP23204 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PparaP23204 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PparaP23204 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PparaP23204 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PparaP23204 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PparaP23204 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PparaP23204 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PparaP23204 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PparaP23204 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PparaP23204 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PparaP23204 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PparaP23204 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PparaP23204 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PparaP23204 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PparaP23204 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PparaP23204 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PparaP23204 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PparaP23204 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PparaP23204 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PparaP23204 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PparaP23204 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms