Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TrhrP21761 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TrhrP21761 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TrhrP21761 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms