Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc2P20801 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnc2P20801 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms