Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spi1P17433 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms