Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30aP15533 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30aP15533 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms