Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhoP15409 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhoP15409 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhoP15409 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhoP15409 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RhoP15409 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhoP15409 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhoP15409 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RhoP15409 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhoP15409 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhoP15409 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RhoP15409 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhoP15409 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhoP15409 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhoP15409 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhoP15409 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RhoP15409 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RhoP15409 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RhoP15409 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RhoP15409 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RhoP15409 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RhoP15409 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RhoP15409 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RhoP15409 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RhoP15409 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhoP15409 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhoP15409 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhoP15409 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhoP15409 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhoP15409 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhoP15409 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhoP15409 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RhoP15409 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhoP15409 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms