Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh3P13705 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh3P13705 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msh3P13705 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh3P13705 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh3P13705 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms