Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp1P11983 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp1P11983 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms