Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prf1P10820 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prf1P10820 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prf1P10820 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prf1P10820 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prf1P10820 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms