Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me1P06801 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me1P06801 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me1P06801 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Me1P06801 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me1P06801 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me1P06801 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me1P06801 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me1P06801 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me1P06801 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me1P06801 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me1P06801 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me1P06801 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me1P06801 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me1P06801 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me1P06801 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me1P06801 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Me1P06801 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Me1P06801 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me1P06801 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me1P06801 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me1P06801 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me1P06801 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me1P06801 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me1P06801 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me1P06801 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me1P06801 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me1P06801 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me1P06801 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms