Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P04213 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P04213 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P04213 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P04213 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P04213 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P04213 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P04213 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
P04213 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P04213 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P04213 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P04213 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P04213 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P04213 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P04213 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P04213 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P04213 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P04213 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P04213 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P04213 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P04213 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P04213 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P04213 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P04213 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P04213 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms