Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53P02340 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tp53P02340 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53P02340 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tp53P02340 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms