Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01787 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01787 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01787 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01787 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01787 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01787 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01787 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01787 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01787 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01787 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01787 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01787 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01787 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01787 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01787 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01787 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms