Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01736 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01736 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01736 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01736 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01736 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01736 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01736 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01736 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01736 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01736 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01736 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01736 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01736 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01736 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01736 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01736 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01736 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms