Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb2O88838 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb2O88838 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb2O88838 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms