Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ShdO88834 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ShdO88834 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ShdO88834 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ShdO88834 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ShdO88834 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ShdO88834 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ShdO88834 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ShdO88834 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ShdO88834 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ShdO88834 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ShdO88834 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ShdO88834 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ShdO88834 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ShdO88834 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ShdO88834 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ShdO88834 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ShdO88834 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ShdO88834 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ShdO88834 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ShdO88834 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ShdO88834 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ShdO88834 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ShdO88834 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ShdO88834 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ShdO88834 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ShdO88834 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ShdO88834 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ShdO88834 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ShdO88834 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ShdO88834 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ShdO88834 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms