Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp4O70480 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp4O70480 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms