Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx7O70439 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx7O70439 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx7O70439 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx7O70439 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx7O70439 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx7O70439 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx7O70439 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Stx7O70439 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx7O70439 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx7O70439 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx7O70439 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx7O70439 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx7O70439 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx7O70439 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx7O70439 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx7O70439 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx7O70439 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx7O70439 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx7O70439 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms