Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dsg2O55111 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms