Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TsksO54887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TsksO54887 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TsksO54887 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TsksO54887 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TsksO54887 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TsksO54887 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TsksO54887 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TsksO54887 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TsksO54887 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TsksO54887 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TsksO54887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TsksO54887 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TsksO54887 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TsksO54887 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TsksO54887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TsksO54887 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TsksO54887 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TsksO54887 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TsksO54887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TsksO54887 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TsksO54887 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TsksO54887 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TsksO54887 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TsksO54887 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TsksO54887 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TsksO54887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TsksO54887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TsksO54887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TsksO54887 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TsksO54887 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TsksO54887 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TsksO54887 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TsksO54887 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TsksO54887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TsksO54887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TsksO54887 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TsksO54887 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TsksO54887 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms