Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin1O54724 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms