Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1baO35930 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1baO35930 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1baO35930 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1baO35930 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1baO35930 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gp1baO35930 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1baO35930 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1baO35930 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms