Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bnc1O35914 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bnc1O35914 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bnc1O35914 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bnc1O35914 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bnc1O35914 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnc1O35914 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bnc1O35914 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bnc1O35914 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Bnc1O35914 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnc1O35914 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnc1O35914 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnc1O35914 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnc1O35914 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnc1O35914 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms