Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpibO35906 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpibO35906 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpibO35906 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpibO35906 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpibO35906 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpibO35906 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpibO35906 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpibO35906 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpibO35906 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpibO35906 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpibO35906 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpibO35906 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpibO35906 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpibO35906 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpibO35906 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpibO35906 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpibO35906 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpibO35906 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpibO35906 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpibO35906 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SpibO35906 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SpibO35906 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SpibO35906 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SpibO35906 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SpibO35906 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms