Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rabep1O35551 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabep1O35551 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabep1O35551 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms