Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eftud2O08810 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms