Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2056J3QQ02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms