Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5294J3QP53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5294J3QP53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms