Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm3J3QMI4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calhm3J3QMI4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms