Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c3J3QJW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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