Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP9

Scgb2a2, Secretoglobin, family 2A, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2a2J3KMP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb2a2J3KMP9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scgb2a2J3KMP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scgb2a2J3KMP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scgb2a2J3KMP9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scgb2a2J3KMP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms