Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfip1G5E8V9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip1G5E8V9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms