Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Arfgef1G3X9K3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arfgef1G3X9K3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms