Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp9yF8VPU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp9yF8VPU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms