Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5218F6YH22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms