Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh18E9Q9Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms