Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b2E9Q3E1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms