Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r238E9Q373 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r238E9Q373 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms