Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms