Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmf1B9EKI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tmf1B9EKI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms