Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp26c1B2RXA7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms