Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp42B2RQC2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms