Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brpf3B2KF05 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms