Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn7aB1AYL1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn7aB1AYL1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn7aB1AYL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms